泌尿及生殖道衣原体感染称为衣原体尿路感染。使人类致病的衣原体有3种即生殖道沙眼衣原体(CT)、鹦鹉热衣原体和肺炎衣原体。40%～50%的非淋菌性尿道炎是由沙眼衣原体引起。衣原体是介于细菌与病毒之间的细胞内寄生物，直径250～500nm，用显微荧光测定法已测知至少有A，B，Ba，C-K，Ll-3等15种血清型，其中8型(D、E、F、G、H、I、J、K)已证实与泌尿生殖道感染有关；D，G，L1，L2与直肠感染有关。不同型别感染引起的泌尿生殖道炎可能对临床表现有影响；同种血清型衣原体感染的复发与淋球菌合并感染有关。衣原体所致的非淋球菌性尿路感染主要由性交传播，潜伏期1～3周。感染特点为男性常感尿道刺痒及排尿微痛，可有尿频、尿急、尿道口红肿和少量黏性分泌物溢出。本病临床表现与淋菌性尿道炎相似，唯程度较轻。部分患者尚可并发前列腺炎、附睾炎及睾丸炎。 女性尿道炎症状常不明显，以黏液脓性宫颈炎最明显，也可伴有前庭大腺炎、阴道炎、盆腔炎。

病因为易感人群中的衣原体感染。传播途径主要由性交传播，性关系混乱、开始性生活年龄过早，及不用安全套的不洁性交尤易传染。少数情况下，新生儿可通过感染本病的母亲分娩时经阴道感染而患病。

本病一般潜伏期1～3周，男性常感尿道刺痒及轻重不等的尿痛及烧灼感，疼痛较淋病轻，尿道口轻度红肿，常有浆液性或浆液脓性尿道分泌物，较淋病性尿道炎分泌物稀薄而少，或仅在晨起时发现尿道口有白膜形成。有的患者症状不明显或无任何症状，而往往被误诊。女性患者主要感染部位为子宫颈，尿道炎症状不明显，常表现为急、慢性宫颈炎和宫颈糜烂、白带增多或者轻度排尿困难和尿频，亦可完全无症状。

未经治疗或治疗不彻底，男性患者可并发急性附睾炎，亦可并发前列腺炎及尿道狭窄。男性同性恋患者可发生直肠炎或咽炎。女性患者可并发急性输卵管炎、子宫内膜炎及盆腔炎，导致不育症和宫外孕。新生儿经产道可感染结膜炎、肺炎。

1.取尿道分泌物涂片镜检(男性患者可从阴茎根部向尿道口轻轻挤按尿道，以求获得较多分泌物；无分泌物患者留晨尿离心取沉渣镜检)，高倍镜下(400×)白细胞10～15个以上，油镜下(1000×)白细胞5个以上，无革兰阴性双球菌，即应高度疑此病。 2.病原学检查沙眼衣原体培养需特殊实验条件，广泛应用较难。现多用特异性单克隆抗体染分泌物涂片，用免疫荧光或免疫酶标技术观察，阳性率达90%以上。核酸扩增法如聚合酶链反应(PCR)和连接酶链反应(LCR)有极好的敏感性。但PCR不推荐用于确诊病人是否治愈，至少不用于治疗结束2周以内的患者，因为对充分治疗的病例，PCR结果阳性的持续时间比培养法长。

患者有临床症状及不洁性交史，尿道分泌物涂片镜检高倍镜下(400×)白细胞10～15个以上，油镜下(1000×)白细胞5个以上，无革兰阴性双球菌，即应高度疑诊此病。本病确诊需病原学检查。现多采用尿道分泌物涂片检查，若高倍视野下白细胞多于10个，同时无革兰阴性双球菌即应高度怀疑此病，通过用特异性单克隆抗体染分泌物涂片，免疫荧光或免疫酶标技术观察，阳性率可达90%以上。 文献报道，衣原体尚能与淋球菌、解脲支原体感染并存，陆春等报道2197例男性性病尿道炎中淋球菌混合感染率44.2%；沙眼衣原体混合感染率44.7%，解脲支原体为58.8%。故对淋病患者应注意本病的存在。

沙眼衣原体对抗生素敏感，治疗不困难，疗程宜长。常用药物如下： 1.四环素0.5g，4次/d，口服共7天，再改为0.25g，4次/d，共服2周。或盐酸多西环素(强力霉素)0.1g或米诺环素(二甲胺四环素)0.1g，2次/d，口服，共服2周。 2.对以上药物不能耐受或疗效不佳者，可用红霉素0.5g，4次/d，共服7天，或阿奇霉素(aziththromycin)1g，一次口服。亦可应用氧氟沙星(氟嗪酸)0.2g，2次/d，口服，共服7～14天。 3.配偶应同时接受相应治疗，疗程结束1周后重复检查。 如果同时患淋病，先治淋病再治衣原体感染。疗程结束1周后要重复检查。治愈标准是症状消失，尿道无分泌物，尿沉渣涂片白细胞数正常(＜5个/高倍视野)。

衣原体对理化因子的抵抗力弱，在人体外仅存活很短时间，人与人之间的性传播是其主要的生存方式。预防衣原体感染主要是避免性乱和积极治疗带菌者，对患者的配偶或性伴侣应双方同治，以防继续传播。